上的展品说明文字不断变换语言和字体。神秘人再次以半透明的形态现身，他的身体由流动的时间颗粒构成："你们以为打败终焉之书的守护者就结束了？在时间的长河里，每个文明都是试图逆流而上的鱼，而新的渔夫...已经撒网了。"他手中出现一张由时空坐标组成的渔网，网眼处闪烁着与紫色漩涡相同的光芒。
许愿的混沌印与时空乱流产生共鸣，印纹中浮现出祖父许一城的残影。残影手中握着一本泛黄的笔记本，上面记载着五脉在民国时期遭遇的"时间瘟疫"——当时的北平城，有人能随意篡改他人的记忆时间线。"新敌人掌握了时间篡改的技术，"许愿的声音带着颤音，"而且...他们在利用文明古迹作为能量节点。"混沌印自动释放出金色的时间锚，试图稳定博物馆内紊乱的时空。
黄烟烟将龙凤剑插入展厅地面，剑身的波纹状纹路与地砖的青花纹饰产生共振。整座博物馆的建筑结构开始重组，明代的飞檐与未来的反重力支架完美融合。当她斩断一根从天花板垂下的机械藤蔓时，藤蔓断面渗出的不是汁液，而是带着油墨味的时间线片段，片段中闪现出某个文明被彻底抹去的瞬间。
药不然的纳米虫组成能解析时空频率的探针，却在接近紫色漩涡时被转化为逆向流动的时间沙。他紧急启动纳米虫的量子纠缠模式，让虫群在不同时间点同时发动攻击。在爆炸的时空涟漪中，他看到了巨型塔楼的内部结构：塔楼每一层都囚禁着一个被篡改时间线的地球，而塔顶，转动着一个刻满所有文明兴衰史的命运轮盘。
木户加奈的星斗盘与时间之海的星图共鸣，在虚空中展开成巨大的罗盘。她念动古老的咒语，召唤出分布在全球的文明守护者意识。但这些意识在接触时空乱流的瞬间，开始出现记忆混乱的症状——有人忘记了自己的身份，有人将敌人的记忆当作真实。千钧一发之际，她将自己的意识注入星斗盘，用绳文时代的精神力构建起记忆防火墙。
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五脉传人决定前往时间之海寻找幽灵战舰。许愿用混沌印打开了一道不稳定的时空通道，通道内涌动着不同文明的时间记忆：古埃及的法老在量子计算机前演算，维多利亚时代的蒸汽火车在星际轨道上奔驰。当他们抵达时间之海时，看到的是漂浮着无数文明残骸的奇异空间，这些残骸的时间属性各不相同，有的正在诞生，有的早已灭亡。
在幽灵战舰的甲板上，站着一群身着银色长袍的身影，他们的面部被流动的时间面具覆盖。为首的身影举起权杖，杖头的宝石投射出地球的全息影像，影像中的文明古迹正在被机械藤蔓彻底同化："地球文明，违背了时空平衡法则。你们对可能性的执着，正在撕裂时间之网。"他挥动权杖，战舰的主炮开始充能，炮口凝聚的不是能量束，而是能将物质还原到初始时间状态的"溯时弹"。
许愿举起混沌印，印纹中浮现出从古至今所有文明在时间困境中挣扎的画面。这些画面化作金色的盾牌，抵挡住了第一波溯时弹的攻击。但混沌印的光芒开始变得不稳定，他的身体出现了时间错位的症状——左手是少年模样，右手却已布满老年斑。
黄烟烟的龙凤剑在时空乱流中吸收了不同文明的锻造技艺，剑身进化出能斩断时间因果的刃纹。她冲向幽灵战舰，每一剑都能斩断一段被篡改的时间线。在战斗中，她看到了五脉先祖们跨越时空的支援：明代的铸剑师送来千年寒铁，未来的武器专家传输量子锻造技术。
药不然将纳米虫改造成能逆转时间熵增的"时间修复者"，虫群涌入幽灵战舰的动力系统。但战舰的防御机制启动，释放出能将纳米虫转化为时间尘埃的反制程序。关键时刻，他将自己的机械义肢与战舰核心连接，用人类的情感代码干扰了冰冷的时间算法。
木户加奈的星斗盘引导着全球文明守护者的意识，在时间之海构建起巨大的精神网络。她通过星图观测到，幽灵战舰的弱点在于其动力核心——那是一个由某个远古文明的时间之神残骸改造而成的装置。当她集中所有力量攻击核心时，星斗盘爆发出耀眼的光芒，光芒中浮现出绳文时代巫女与时间之神对话的场景。
当所有力量汇聚的刹那，许愿的混沌印、黄烟烟的龙凤剑、药不然的纳米虫、木户加奈的星斗盘产生共鸣，形成能穿透时空法则的"命运之矛"。矛尖刺破幽灵战舰的瞬间，时间面具下的身影们露出了惊恐的表情："不可能...你们竟然能..."随着战舰的崩解，他们的身体化作无数时间颗粒，融入了时间之海。
时空潮汐逐渐平息，全球的文明古迹开始自我修复。许愿的身体因为过度使用时间之力，永远失去了年龄增长的能力，但混沌印却能感知到任何时间异常。黄烟烟用收集到的时空碎片，重铸了龙凤剑，剑身刻满了不同文明的时间图腾。药不然将时间修复者纳米虫散布到全球，这些虫群成为了守护时空稳定的哨兵。木户加奈的星斗盘与时间之海建立了永久连接，她开始研究如何在不破坏平衡的前提下探索时间的奥秘。
然而，在时间之海的最深处，一个比幽灵战舰更庞大的存在正在苏醒。那是一座由"时间悖论"构成的巨型堡垒，堡垒的墙壁上刻满了所有文明试图篡改时间的失败案例。堡垒中央的王座上，坐着一个由过去、现在、未来三个形态组成的神秘存在，它的手中握着一本黑色封面的书，封面上用时空法则写着：《终末时间典章》。它的声音在时间之海回荡："小小的虫子们，真正的时间审判...才刚刚开始。"与此同时，地球的文明可能性博物馆内，一块来自幽灵战舰的碎片突然发光，碎片表面浮现出倒计时：365:00:00:00。新一轮跨越时空的文明危机，正在黑暗中悄然逼近。