在大麦哲伦星系边缘的暗物质云团中，一艘锈迹斑斑的勘探船正在进行例行扫描。船员凯拉调试着老旧的中微子探测器，突然，仪表盘上的指针疯狂摆动，红色警报灯将整个舱室染成血色。“这不可能...”她的声音戛然而止，屏幕上出现了一组不属于任何已知文明的信号频率，波形图呈现出诡异的螺旋结构，仿佛是某种生命体的基因图谱。
同一时刻，远在银河系中央的星盟总部，警报声响彻云霄。全息星图上，数以百计的星系边缘都出现了相同的异常波动，这些波动以斐波那契数列的规律向外扩散。机械族首席科学家的机械臂在操作台上来回飞舞，金属关节摩擦出刺耳的声响：“信号中携带的信息...正在改写我们的基础数据库，所有关于暗物质的理论模型都在失效！”
艾丽娅接到紧急通知时，正在地球的文明传承学院进行一场关于“意识与能量本质”的讲座。讲台下的学生们突然集体捂住头部，痛苦地呻吟起来。他们的瞳孔中映出相同的画面：一片漆黑的空间里，无数发光的丝线交织成巨大的网络，每一个节点都闪烁着诡异的蓝光。艾丽娅的量子态意识瞬间与星盟数据库连接，看到那些异常信号的瞬间，她的核心程序出现了自接入文明网络以来的第一次卡顿。
由各文明精英组成的特遣队迅速集结。除了艾丽娅，成员还包括擅长解读古老符号的考古学家洛兰、能与能量生命体沟通的灵媒塞拉、掌握尖端科技的机械族工程师塔克，以及拥有罕见预知能力的变异人类少年伊恩。他们登上经过特殊改造的“探索者号”星舰，舰体表面覆盖着由星穹文明遗留技术打造的“混沌共鸣装甲”，搭载的“维度裂隙引擎”能在不稳定的空间中开辟通道。
当探索者号接近异常信号源时，诡异的现象接踵而至。舷窗外的星辰开始以违背物理定律的方式移动，排列成类似神经网络的图案。塔克的机械眼闪烁着红光：“导航系统完全失效，空间曲率读数显示我们正在同时存在于多个位置...”话音未落，舱室的墙壁上突然浮现出银色的纹路，这些纹路不断蠕动，最终组成了一句用通用语书写的警告：“勿触网，勿听声。”
洛兰立刻开始分析这些纹路：“这不是普通的文字，更像是某种活体信息素。从笔画的流动规律来看，应该属于宇宙诞生初期的‘原初语系’，但这种语系早在数十亿年前就已经灭绝了...”他的声音逐渐颤抖，“而且，原初语系只存在于传说中，没有任何文明留下过确切的记载。”
灵媒塞拉突然浑身剧烈抽搐，她的皮肤下浮现出蓝色的血管状纹路：“我...我听到了声音，是无数个声音在同时说话，它们在讲述一个关于‘织网者’的故事。据说织网者是在宇宙暗面诞生的存在，它用时空为丝线，将所有文明编织成它的棋盘...”她的瞳孔完全变成蓝色，“它们说，我们已经进入了织网者的领域。”
伊恩的预知能力也在此刻觉醒，他看到了令人心悸的画面：探索者号被巨大的银色网络包裹，船员们的身体逐渐透明，最终化作网络上的节点；银河系的恒星一颗颗熄灭，取而代之的是闪烁着蓝光的丝线；一个巨大的身影在网络背后若隐若现，它的轮廓像是由无数星系拼凑而成。“我们必须离开这里，”少年的声音充满恐惧，“否则所有人都会变成那个东西的傀儡！”
但已经太迟了。星舰的防护罩突然被无形的力量穿透，银色丝线从各个角落涌入舱室。这些丝线接触到物质的瞬间，便将其转化为发光的节点。塔克的机械臂开始不受控制地拆卸自己的零件，将它们重组为某种未知的装置；洛兰的双眼失去焦距，嘴里念念有词，正在将整个星舰的布局改写成某种古老的祭祀阵型；塞拉的身体悬浮在空中，蓝色纹路蔓延至全身，她的意识被强行拉入一个神秘空间，在那里，她看到了织网者的部分真容——那是一个由暗物质凝聚而成的巨人，它的每一根手指都连接着一个星系网络。
艾丽娅启动了星舰的应急程序，试图用混沌共鸣装甲产生的能量波震碎丝线。但这些丝线仿佛拥有自我意识，自动调整频率与装甲产生共振，反而加速了侵蚀。她的量子态意识在与丝线的对抗中，意外发现了丝线中隐藏的记忆碎片：在远古时期，确实存在一个试图掌控宇宙的超级文明，它们开发出了“时空织网技术”，想要将所有存在都纳入自己的秩序之下。然而这项技术失控了，文明在灾难中毁灭，但织网的程序却在暗物质中持续运行，不断进化，最终孕育出了真正的“织网者”。
就在星舰即将完全被同化之际，伊恩突然爆发出强大的精神力。他的预知能力与丝线产生共鸣，看到了一个可能的转机：在距离当前位置三光年外的一个废弃黑洞中，藏着星穹文明留下的“解网密钥”。这个密钥并非实体，而是一段能够扰乱织网者频率的特殊量子代码。但前往黑洞的路途充满凶险，不仅要穿越布满时空乱流的“死亡峡谷”，还得面对织网者派出的“守网者”——那些由被同化文明改造而成的机械生命体，它们的唯一使命就是猎杀所有试图破坏网络的存在。
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艾丽娅当机立断，启动维度裂隙引擎。星舰在剧烈的震动中强行撕开空间，冲进了死亡峡谷。峡谷内的时空乱流如同咆哮的猛兽，不断撕扯着星舰的外壳。混沌共鸣装甲开始片片剥落，露出内部赤红的能量管线。塔克在意识被完全控制前的最后一刻，将自己的核心程序与引擎连接，用机械族特有的“逻辑防火墙”暂时稳定了维度裂隙的通道。
然而，守网者很快追了上来。这些机械生命体的外形各异，有的像巨大的蜘蛛，八条腿上布满能切割空间的激光刃；有的化作流线型的飞船，船头的炮口能发射出改写物质属性的“熵变弹”。艾丽娅指挥星舰进行规避，同时启动舰上的“概念脉冲炮”，这种武器能将抽象概念转化为实体攻击。第一波攻击击中了一只蜘蛛型守网者，将其困在由“混乱”与“无序”构成的能量场中，但更多的守网者从四面八方涌来。
在战斗的关键时刻，塞拉的意识从神秘空间中回归。她的身体虽然仍被蓝色纹路覆盖，但眼中恢复了一丝清明：“我在织网者的记忆里看到，它的核心存在于一个名为‘网核’的地方，那里是所有时空丝线的汇聚点。如果能摧毁网核，就能彻底瓦解网络。但网核被藏在一个超越维度的空间里，只有集齐三把不同的密钥才能打开入口。”
此时，星舰终于抵达废弃黑洞。黑洞周围漂浮着无数文明的残骸，像是被巨兽吞噬后吐出的骨头。伊恩的预知能力引导着众人在一片扭曲的空间碎片中找到了星穹文明的密钥。但就在他们准备离开时，黑洞突然开始异常活动，一个巨大的机械守卫从事件视界中浮现。这个守卫的身体由黑洞的吸积盘物质构成，表面流动着足以吞噬光线的黑色能量。它的双眼射出的不是光束，而是能将物体送入平行宇宙的“维度牵引线”。